На территории национального парка и объединенного с ним федерального заказника «Земля Франца-Иосифа» обитают семь видов, занесенных в Красную книгу России и Международную Красную книгу, это белый медведь, атлантический морж, морской единорог - нарвал, гренландский кит, белая чайка, а также новоземельский северный олень и атлантическая черная казарка.
Как отметил корреспонденту ИТАР-ТАСС руководитель экспедиционных исследований, замдиректора парка по научной работе Марии Гаврило, нанесение на карты-схемы мест обитания популяций на архипелаге редких млекопитающих и белого медведя позволит в дальнейшем разработать методологическую базу для отслеживания их сезонного распределения. Полученные данные планируется использовать для изучения различных аспектов экологии и поведения видов, а также для совершенствования методов охраны редких млекопитающих и их мест обитания, разработки мер по сохранению популяций, в первую очередь для целей экологического туризма на арктических территориях.